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PCR實驗室在操作時應(yīng)注意事項
時間:2019-08-07
PCR(基因擴(kuò)增實驗室)檢測微量感染因子時,操作人員容易因為污染而導(dǎo)致各種問題。SLD中檢實驗室技術(shù)根據(jù)多年行業(yè)經(jīng)驗,給出的建議是:進(jìn)行PCR操作時,操作人員一定要嚴(yán)格遵守一些操作規(guī)程,最大程度地降低可能出現(xiàn)的PCR污染事故的發(fā)生。?
一、PCR實驗室劃分操作區(qū):?
目前,對于普通PCR,業(yè)內(nèi)還無法做到單人單管和實現(xiàn)完全封閉管理操作,但無論是否能夠達(dá)到單人單管,均要求實驗操作在三個不同的物理區(qū)域內(nèi)進(jìn)行,PCR的前處理和后處理一定要設(shè)計在不同的隔離區(qū)內(nèi)進(jìn)行:?
1、標(biāo)本處理區(qū),包括:擴(kuò)增摸板制備;??
2、PCR擴(kuò)增區(qū),包括:反應(yīng)液的配制和PCR基因擴(kuò)增;??
3、產(chǎn)物分析區(qū),包括:凝膠電泳分析,產(chǎn)物拍照及重組克隆制備。??
各工作區(qū)要具有一定的隔離,操作器材要專用,而且要有一定方向性,如,?標(biāo)本制備→?PCR擴(kuò)增→?產(chǎn)物分析→④產(chǎn)物處理。切記:產(chǎn)物分析區(qū)的產(chǎn)物及器材嚴(yán)禁拿到前后兩個工作區(qū),避免交叉污染。?
二、PCR實驗室試劑分裝要求:?
PCR擴(kuò)增所需要的試劑均應(yīng)在裝有紫外燈的負(fù)壓工作臺或超凈工作臺進(jìn)行配制和分裝,所有的吸頭和加樣器都需固定放于其中,吸頭不能用來吸取擴(kuò)增后的DNA和其它來源DNA:??
1、PCR用水應(yīng)為高壓的雙蒸水;?
2、引物和d-NTP用高壓的雙蒸水在無PCR擴(kuò)增產(chǎn)物區(qū)配制;?
3、引物和d-NTP應(yīng)分裝儲存,分裝時應(yīng)標(biāo)明分裝時間,以備發(fā)生污染時及時查找原因和追溯污染源頭;??
三、PCR擴(kuò)增重要標(biāo)準(zhǔn)??
1、PCR實驗靈敏度?
PCR實驗靈敏度:是指PCR擴(kuò)增反應(yīng)能夠檢測到目的基因的最小值。?研究結(jié)果表明,影響PCR擴(kuò)增效率的因素,有模板的完整性、反應(yīng)溫度、復(fù)雜程度、引物純度及其與模板結(jié)合效率、DNA聚合酶的熱穩(wěn)定性與擴(kuò)增性能、反應(yīng)緩沖液的離子組成(主要指:陽離子)、反應(yīng)優(yōu)化劑等,這些因素都顯著影響
PCR實驗檢測靈敏度。在最佳擴(kuò)增條件下,常規(guī)PCR反應(yīng)能夠檢測到pg(10~12g)數(shù)量級目的基因。對于一個特定的目的基因,模板與引物通常都是已經(jīng)限定好的因素。因此,選擇什么樣的PCR反應(yīng)體系(包括DNA聚合酶與反應(yīng)緩沖液等)就是研究者提高PCR實驗靈敏度的關(guān)鍵因素了。??
2、PCR實驗特異性???
PCR實驗特異性:是指在PCR擴(kuò)增過程中,專一性擴(kuò)增目的片段而非其他
片段的性能。?
在PCR實驗本身的靈敏度很高,且實驗條件未充分優(yōu)化的情況下,通常會在目的片段出現(xiàn)同時伴隨有其它雜帶,即發(fā)生非特異性擴(kuò)增現(xiàn)象。模板、引物性質(zhì)及質(zhì)量、反應(yīng)條件控制等均會影響PCR擴(kuò)增特異性。近年來的研究結(jié)果表明,緩沖液品質(zhì)(如反應(yīng)優(yōu)化劑、離子種類與組成等)對保證PCR特異性擴(kuò)增起著重要作用。??
3、PCR靈敏性和特異性關(guān)聯(lián)?
PCR實驗靈敏度與特異性是一對此長彼消特性,這也決定我們實驗體系調(diào)節(jié)實際上就是需要找到適合實驗靈敏度與特異性的平衡點。由于PCR體系中的成分眾多,使得組合較多,篩選工作也就相對繁雜。?四、PCR實驗操作注意事項:?
盡管PCR擴(kuò)增序列的殘留污染大部分是假陽性反應(yīng)導(dǎo)致的,但樣品間的交叉污染也是常見原因之一。因此,不僅要在進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng)時要謹(jǐn)慎對待,在樣品的收集、抽提和擴(kuò)增的所有環(huán)節(jié)都應(yīng)謹(jǐn)慎操作,一般需做到以下幾點:?
1、戴一次性手套,若不小心濺上反應(yīng)液,應(yīng)立即更換手套;?
2、避免反應(yīng)液飛濺,若不小心濺到手套或桌面上,應(yīng)立刻更換手套并用稀酸擦拭桌面;?
3、使用一次性吸頭,嚴(yán)禁與PCR產(chǎn)物分析室的吸頭混用,吸頭不要長時間暴露于空氣中,避免空氣中氣溶膠的污染;?
4、操作多份樣品時,制備反應(yīng)混合液,先將dNTP、緩沖液、引物和酶混合好,然后再分裝,這樣既可以減少操作次數(shù),避免污染,又可以增加反應(yīng)的精確度;?
5、最后加入反應(yīng)模板,加入后蓋緊反應(yīng)管;?
6、操作時設(shè)立空白對照和陰陽性對照,既可驗證PCR反應(yīng)的可靠性,又可
以協(xié)助判斷擴(kuò)增系統(tǒng)的可信性;?
7、由于實際操作時加樣器很容易受產(chǎn)物氣溶膠或標(biāo)本DNA的污染,所以操作者最好使用高壓處理過的或可替換的加樣器。假如沒有這種特殊的加樣器,至少在PCR操作過程中加樣器應(yīng)該專用,嚴(yán)禁交叉使用,尤其是PCR產(chǎn)物分析所用加樣器不能拿到其它兩個相鄰區(qū)域使用;?
8、重復(fù)實驗,驗證結(jié)果,慎下結(jié)論。?
五、綜述:?
由于PCR實驗操作非常專業(yè),在設(shè)計PCR基因擴(kuò)增實驗室時設(shè)計師也要充分考慮上述技術(shù)要求,避免PCR實驗室在后續(xù)使用時出現(xiàn)返工、返修問題。